Uma década depois dos eventos do primeiro “Avatar” e conta a história da família Sully, Jake Sully (Sam Worthington), agora completamente Na’vi, a sua parceira Neytiri (Zoe Saldaña) e os seus filhos, os desafios que enfrentam, aquilo que são capazes de fazer para se proteger, as batalhas que são forçados a travar para sobreviver e as tragédias que daí resultam.

Com o regresso do “Povo do Céu”, nome como os Na’vi designam os humanos, o casal é forçado a fugir para o mundo aquático de Metkayina, um refúgio onde terão de aprender rapidamente a sobreviver debaixo de água.